Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SS18Q15532 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SS18Q15532 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SS18Q15532 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SS18Q15532 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SS18Q15532 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SS18Q15532 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SS18Q15532 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SS18Q15532 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SS18Q15532 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SS18Q15532 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SS18Q15532 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SS18Q15532 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SS18Q15532 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SS18Q15532 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SS18Q15532 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SS18Q15532 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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