Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 YAR029WYAR029W 225 nt3.37□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 RPL19BYBL027W 570 nt3.37□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 RFC3YNL290W 1023 nt3.37□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 TRS120YDR407C 3870 nt3.37□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 NMA111YNL123W 2994 nt3.37□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 MNT3YIL014W 1893 nt3.37□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 BNI4YNL233W 2679 nt3.37□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 CCT7YJL111W 1653 nt3.36□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 APE2YKL157W 2859 nt3.36□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 YFL032WYFL032W 321 nt3.36□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 ROX1YPR065W 1107 nt3.36□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 SNX41YDR425W 1878 nt3.36□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 VBA4YDR119W 2307 nt3.36□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 PWP2YCR057C 2772 nt3.35□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 MCM22YJR135C 720 nt3.35□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 YPL238CYPL238C 390 nt3.35□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 RDS1YCR106W 2499 nt3.35□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 RRN6YBL014C 2685 nt3.35□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 PHM6YDR281C 315 nt3.34□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.34□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 GPI10YGL142C 1851 nt3.34□□□□□ -1.87
YKR011CQ02209 MTR4YJL050W 3222 nt3.34□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 DNM1YLL001W 2274 nt3.33□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 MRPL20YKR085C 588 nt3.33□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 PRE8YML092C 753 nt3.33□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 BIT61YJL058C 1632 nt3.33□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 REG1YDR028C 3045 nt3.33□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 JEN1YKL217W 1851 nt3.33□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 PDC2YDR081C 2778 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 AAD16YFL057C 459 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 BAT1YHR208W 1182 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 MSL1YIR009W 336 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 COX19YLL018C-A 297 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 AIM32YML050W 936 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 snR36snR36 182 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 NDD1YOR372C 1665 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 TAF1YGR274C 3201 nt3.32□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 OSH3YHR073W 2991 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 AIP1YMR092C 1848 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 HOP2YGL033W 657 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 URM1YIL008W 300 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 RPL39YJL189W 156 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YJL202CYJL202C 348 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YPR014CYPR014C 330 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 MSH2YOL090W 2895 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 SPT10YJL127C 1923 nt3.31□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 RSC1YGR056W 2787 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 XRS2YDR369C 2565 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 IES6YEL044W 501 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YEL057CYEL057C 702 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 TIM12YBR091C 330 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 STE5YDR103W 2754 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 TFB1YDR311W 1929 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 RNR1YER070W 2667 nt3.3□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 HPA3YEL066W 540 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 TIM8YJR135W-A 264 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 SHE2YKL130C 741 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 SSN8YNL025C 972 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 EGD1YPL037C 474 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 snR191snR191 274 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 CDH1YGL003C 1701 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 SPA2YLL021W 4401 nt3.29□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 DAN4YJR151C 3486 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 PEX4YGR133W 552 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 PAU14YIL176C 363 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 PAU1YJL223C 363 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YMR320WYMR320W 306 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YPR077CYPR077C 372 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 YBR137WYBR137W 540 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 SEA4YBL104C 3117 nt3.28□□□□□ -1.88
YKR011CQ02209 RMT2YDR465C 1239 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 COX23YHR116W 456 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 TMA19YKL056C 504 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 ALA1YOR335C 2877 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 SSY1YDR160W 2559 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 ATG21YPL100W 1491 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 RAD4YER162C 2265 nt3.27□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 URA2YJL130C 6645 nt3.26□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 YDR250CYDR250C 276 nt3.26□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 CAJ1YER048C 1176 nt3.26□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 RPS23AYGR118W 438 nt3.26□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 RPS22BYLR367W 393 nt3.26□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 MDN1YLR106C 14733 nt3.26□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 VPS3YDR495C 3036 nt3.26□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 YLR352WYLR352W 2424 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 STU1YBL034C 4542 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 HMF1YER057C 390 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 YLR031WYLR031W 561 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 PGA1YNL158W 597 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 SWD3YBR175W 948 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 COX1Q0045 1605 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 IOC3YFR013W 2364 nt3.25□□□□□ -1.89
YKR011CQ02209 MYO5YMR109W 3660 nt3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.8 ms