Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
J3KRW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
J3KRW8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
J3KRW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
J3KRW8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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