Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHCHD3Q9NX63 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms