Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NID2Q14112 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NID2Q14112 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NID2Q14112 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NID2Q14112 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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NID2Q14112 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NID2Q14112 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NID2Q14112 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NID2Q14112 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NID2Q14112 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NID2Q14112 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NID2Q14112 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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