Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BHMG1C9JSJ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BHMG1C9JSJ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms