Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNE4Q8N205 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNE4Q8N205 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms