Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBXN7O94888 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBXN7O94888 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms