Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCF2L2Q86YR7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCF2L2Q86YR7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.3 ms