Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLRP13Q86W25 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP13Q86W25 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms