Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RIGQ13278 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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