Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YKL044WYKL044W 321 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 MCR1YKL150W 909 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 NNT1YLR285W 786 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 AAR2YBL074C 1068 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YSY6YBR162W-A 198 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 VPS3YDR495C 3036 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 ADY4YLR227C 1482 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 PES4YFR023W 1836 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 SMC2YFR031C 3513 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 EXO5YBR163W 1758 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YSP2YDR326C 4317 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 HNT1YDL125C 477 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 RPL30YGL030W 318 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YGL039WYGL039W 1047 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 PET54YGR222W 882 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 VMA10YHR039C-A 345 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 DDR48YMR173W 1293 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YOR199WYOR199W 330 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 MSS18YPR134W 807 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YKR078WYKR078W 1758 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 PSP1YDR505C 2526 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 SYO1YDL063C 1863 nt3.2□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 PPN1YDR452W 2025 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YER006C-AYER006C-A 318 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 AIM29YKR074W 468 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 AFB1YLR040C 675 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YKE2YLR200W 345 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YLR224WYLR224W 1110 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YLR287CYLR287C 1068 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 PFY1YOR122C 381 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 CDC40YDR364C 1368 nt3.19□□□□□ -1.9
HER1Q12276 VTC4YJL012C 2166 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 DAS1YJL149W 1992 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 DRS2YAL026C 4068 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 TCP1YDR212W 1680 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 snR59snR59 78 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YDR262WYDR262W 819 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 CPR5YDR304C 678 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YER135CYER135C 393 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 DAD2YKR083C 402 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YLR101CYLR101C 396 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 SPP382YLR424W 2127 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 ERG2YMR202W 669 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 TIF11YMR260C 462 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 AFT2YPL202C 1251 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 DPB3YBR278W 606 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 snR54snR54 86 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 VPS53YJL029C 2469 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 SWC4YGR002C 1431 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 TFC1YBR123C 1950 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 RPN1YHR027C 2982 nt3.18□□□□□ -1.9
HER1Q12276 POL2YNL262W 6669 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 NCS2YNL119W 1482 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 BCH1YMR237W 2175 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 MDM36YPR083W 1740 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 RTS3YGR161C 792 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YOR331CYOR331C 558 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YPL185WYPL185W 396 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 MBA1YBR185C 837 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 STP2YHR006W 1626 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 DAL5YJR152W 1632 nt3.17□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YMR317WYMR317W 3423 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 HFM1YGL251C 3564 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 RSC1YGR056W 2787 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 SWF1YDR126W 1011 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 RTT102YGR275W 474 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 PEP8YJL053W 1140 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 RPS21BYJL136C 264 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 TDA8YAL064C-A 381 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YML108WYML108W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 RPL19BYBL027W 570 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 INO4YOL108C 456 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YOR053WYOR053W 342 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 AIM4YBR194W 372 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 MAK21YDR060W 3078 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 PFK26YIL107C 2484 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 SLK19YOR195W 2466 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 SHE4YOR035C 2370 nt3.16□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YAK1YJL141C 2424 nt3.15□□□□□ -1.9
HER1Q12276 GPI13YLL031C 3054 nt3.15□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YGR073CYGR073C 372 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPS20YHL015W 366 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 PCL5YHR071W 690 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 RPA12YJR063W 378 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 CMC2YBL059C-A 330 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 YNL089CYNL089C 477 nt3.15□□□□□ -1.91
HER1Q12276 SRL1YOR247W 633 nt3.15□□□□□ -1.91
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