Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 RSA1YPL193W 1146 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 AIM4YBR194W 372 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 VBA4YDR119W 2307 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 RRI2YOL117W 1938 nt3.31□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SEC15YGL233W 2733 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 GYL1YMR192W 2163 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 HNT1YDL125C 477 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YDR442WYDR442W 393 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SRL3YKR091W 741 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SDO1YLR022C 753 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 PFY1YOR122C 381 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YPR077CYPR077C 372 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 RPB5YBR154C 648 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 BYE1YKL005C 1785 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YOR296WYOR296W 3870 nt3.3□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SKN7YHR206W 1869 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 LIF1YGL090W 1266 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SPO13YHR014W 876 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YLR171WYLR171W 390 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 PBI2YNL015W 228 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YOR169CYOR169C 465 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 PRM3YPL192C 402 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 snR42snR42 351 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YDL180WYDL180W 1644 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 SRB4YER022W 2064 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YSP2YDR326C 4317 nt3.29□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YCG1YDR325W 3108 nt3.28□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YDL009CYDL009C 324 nt3.28□□□□□ -1.88
VFA1P40080 YDL032WYDL032W 312 nt3.28□□□□□ -1.88
VFA1P40080 PEX10YDR265W 1014 nt3.28□□□□□ -1.88
VFA1P40080 GPI15YNL038W 690 nt3.28□□□□□ -1.88
VFA1P40080 GDS1YOR355W 1569 nt3.28□□□□□ -1.88
VFA1P40080 URB2YJR041C 3525 nt3.28□□□□□ -1.88
VFA1P40080 GCD6YDR211W 2139 nt3.28□□□□□ -1.89
VFA1P40080 XRN1YGL173C 4587 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 DBF20YPR111W 1695 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 STP2YHR006W 1626 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 STE23YLR389C 3084 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 BNA7YDR428C 786 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YGR242WYGR242W 309 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YLR297WYLR297W 390 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 ILV5YLR355C 1188 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RPS23BYPR132W 438 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 HEH2YDR458C 1992 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RAD5YLR032W 3510 nt3.27□□□□□ -1.89
VFA1P40080 MSB2YGR014W 3921 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 SSF1YHR066W 1362 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 KHA1YJL094C 2622 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 REG1YDR028C 3045 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 EPL1YFL024C 2499 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YCR090CYCR090C 549 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YGL015CYGL015C 393 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RPS23AYGR118W 438 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YAP3YHL009C 993 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 SDH3YKL141W 597 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RPL23AYBL087C 414 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 ATG3YNR007C 933 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RPL20BYOR312C 519 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 VID24YBR105C 1089 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 SSP1YHR184W 1716 nt3.26□□□□□ -1.89
VFA1P40080 MNT3YIL014W 1893 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 BI2Q0110 1272 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YKT6YKL196C 603 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 SAS2YMR127C 1017 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 TOM22YNL131W 459 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YPR050CYPR050C 414 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 ARO1YDR127W 4767 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 JJJ2YJL162C 1752 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 BI4Q0120 1917 nt3.25□□□□□ -1.89
VFA1P40080 KRE5YOR336W 4098 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 BNI4YNL233W 2679 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RPN2YIL075C 2838 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 AHC2YCR082W 387 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 PAU10YDR542W 363 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YER119C-AYER119C-A 372 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 PAU11YGL261C 363 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 GEP4YHR100C 558 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YKL063CYKL063C 504 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 PAU4YLR461W 363 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 CTK3YML112W 891 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 PWP2YCR057C 2772 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 PBS2YJL128C 2007 nt3.24□□□□□ -1.89
VFA1P40080 MSH2YOL090W 2895 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 STN1YDR082W 1485 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 DLS1YJL065C 504 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 PHD1YKL043W 1101 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 DAD2YKR083C 402 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 IGO1YNL157W 507 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 BUD21YOR078W 645 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RRG8YPR116W 834 nt3.23□□□□□ -1.89
VFA1P40080 RPN1YHR027C 2982 nt3.23□□□□□ -1.89
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