Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEFF2Q9UIK5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms