Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHCHD3Q9NX63 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHCHD3Q9NX63 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms