Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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RRN3P1Q2M238 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RRN3P1Q2M238 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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