Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEC24CP53992 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms