Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FCER1AP12319 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FCER1AP12319 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms