Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4AO75164 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4AO75164 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms