Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLF12Q9Y4X4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms