Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD60Q9BZ19 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD60Q9BZ19 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms