Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTD1Q8N815 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTD1Q8N815 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms