Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3C1V9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3C1V9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3C1V9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Q3C1V9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3C1V9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q3C1V9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q3C1V9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3C1V9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms