Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD8Q15843 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD8Q15843 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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