Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD21O60216 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD21O60216 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD21O60216 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD21O60216 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD21O60216 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD21O60216 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD21O60216 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD21O60216 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms