RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586773.5

CIRBP-211, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-211ENST00000586773 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.14■■■■■ 5.62
CIRBP-211ENST00000586773 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.69■■■■■ 4.74
CIRBP-211ENST00000586773 ABCC9O60706 1549 aa43.9■■■■■ 4.62
CIRBP-211ENST00000586773 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.2■■■■■ 4.35
CIRBP-211ENST00000586773 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.11■■■■■ 4.33
CIRBP-211ENST00000586773 NACADO15069 1562 aa42.1■■■■■ 4.33
CIRBP-211ENST00000586773 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.77■■■■■ 4.28
CIRBP-211ENST00000586773 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
CIRBP-211ENST00000586773 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.49■■■■■ 4.23
CIRBP-211ENST00000586773 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.13■■■■■ 4.17
CIRBP-211ENST00000586773 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41■■■■■ 4.151e-14■■□□□ 12.8
CIRBP-211ENST00000586773 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.81■■■■■ 4.12
CIRBP-211ENST00000586773 SCRIBQ14160 1630 aa40.71■■■■■ 4.11
CIRBP-211ENST00000586773 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.49■■■■■ 4.07
CIRBP-211ENST00000586773 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.42■■■■■ 4.06
CIRBP-211ENST00000586773 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
CIRBP-211ENST00000586773 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.69■■■■□ 3.94
CIRBP-211ENST00000586773 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.49■■■■□ 3.91
CIRBP-211ENST00000586773 SMARCA4P51532 1647 aa38.94■■■■□ 3.82
CIRBP-211ENST00000586773 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
CIRBP-211ENST00000586773 NCAPD3P42695 1498 aa38.82■■■■□ 3.81
CIRBP-211ENST00000586773 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.79■■■■□ 3.8
CIRBP-211ENST00000586773 SMARCA2P51531 1590 aa38.78■■■■□ 3.8
CIRBP-211ENST00000586773 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.61■■■■□ 3.77
CIRBP-211ENST00000586773 HMGXB3Q12766 1538 aa38.6■■■■□ 3.77
CIRBP-211ENST00000586773 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.57■■■■□ 3.76
CIRBP-211ENST00000586773 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CIRBP-211ENST00000586773 WIZO95785 1651 aa38.18■■■■□ 3.7
CIRBP-211ENST00000586773 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
CIRBP-211ENST00000586773 ERCC6Q03468 1493 aa37.93■■■■□ 3.66
CIRBP-211ENST00000586773 NESP48681 1621 aa37.89■■■■□ 3.66
CIRBP-211ENST00000586773 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.85■■■■□ 3.65
CIRBP-211ENST00000586773 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
CIRBP-211ENST00000586773 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.7■■■■□ 3.63
CIRBP-211ENST00000586773 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.65■■■■□ 3.62
CIRBP-211ENST00000586773 CUX2O14529 1486 aa37.58■■■■□ 3.61
CIRBP-211ENST00000586773 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.45■■■■□ 3.59
CIRBP-211ENST00000586773 CFTRP13569 1480 aa37.4■■■■□ 3.58
CIRBP-211ENST00000586773 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CIRBP-211ENST00000586773 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.35■■■■□ 3.57
CIRBP-211ENST00000586773 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.26■■■■□ 3.55
CIRBP-211ENST00000586773 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.25■■■■□ 3.55
CIRBP-211ENST00000586773 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.21■■■■□ 3.55
CIRBP-211ENST00000586773 PRDM2Q13029 1718 aa37.1■■■■□ 3.53
CIRBP-211ENST00000586773 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
CIRBP-211ENST00000586773 WDR62O43379 1518 aa37.06■■■■□ 3.52
CIRBP-211ENST00000586773 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
CIRBP-211ENST00000586773 ABCC8Q09428 1581 aa36.7■■■■□ 3.47
CIRBP-211ENST00000586773 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.68■■■■□ 3.46
CIRBP-211ENST00000586773 TOPBP1Q92547 1522 aa36.61■■■■□ 3.45
CIRBP-211ENST00000586773 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.57■■■■□ 3.44
CIRBP-211ENST00000586773 IFT140Q96RY7 1462 aa36.48■■■■□ 3.43
CIRBP-211ENST00000586773 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CIRBP-211ENST00000586773 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CIRBP-211ENST00000586773 CUX1P39880 1505 aa36.22■■■■□ 3.39
CIRBP-211ENST00000586773 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
CIRBP-211ENST00000586773 SOGA1O94964 1423 aa36.19■■■■□ 3.38
CIRBP-211ENST00000586773 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.18■■■■□ 3.38
CIRBP-211ENST00000586773 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
CIRBP-211ENST00000586773 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.11■■■■□ 3.37
CIRBP-211ENST00000586773 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.362e-10■■■■■ 32.2
CIRBP-211ENST00000586773 OSCARQ8IYS5 282 aa36.06■■■■□ 3.36
CIRBP-211ENST00000586773 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36■■■■□ 3.351e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-211ENST00000586773 WDR97A6NE52 1622 aa35.98■■■■□ 3.35
CIRBP-211ENST00000586773 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
CIRBP-211ENST00000586773 TOP2BQ02880 1626 aa35.9■■■■□ 3.34
CIRBP-211ENST00000586773 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.89■■■■□ 3.34
CIRBP-211ENST00000586773 SYNJ1O43426 1573 aa35.83■■■■□ 3.33
CIRBP-211ENST00000586773 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.83■■■■□ 3.33
CIRBP-211ENST00000586773 GRIN2BQ13224 1484 aa35.79■■■■□ 3.32
CIRBP-211ENST00000586773 FBLN2P98095 1184 aa35.78■■■■□ 3.32
CIRBP-211ENST00000586773 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.75■■■■□ 3.31
CIRBP-211ENST00000586773 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.72■■■■□ 3.31
CIRBP-211ENST00000586773 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CIRBP-211ENST00000586773 CHD1O14646 1710 aa35.7■■■■□ 3.31
CIRBP-211ENST00000586773 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.66■■■■□ 3.3
CIRBP-211ENST00000586773 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CIRBP-211ENST00000586773 PBRM1Q86U86 1689 aa35.65■■■■□ 3.3
CIRBP-211ENST00000586773 SYNJ2O15056 1496 aa35.57■■■■□ 3.28
CIRBP-211ENST00000586773 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.42■■■■□ 3.26
CIRBP-211ENST00000586773 TRIM41Q8WV44 630 aa35.41■■■■□ 3.26
CIRBP-211ENST00000586773 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.38■■■■□ 3.25
CIRBP-211ENST00000586773 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.38■■■■□ 3.25
CIRBP-211ENST00000586773 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.38■■■■□ 3.25
CIRBP-211ENST00000586773 ARHGEF11O15085 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
CIRBP-211ENST00000586773 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.34■■■■□ 3.25
CIRBP-211ENST00000586773 ADAMTS12P58397 1594 aa35.34■■■■□ 3.25
CIRBP-211ENST00000586773 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.3■■■■□ 3.24
CIRBP-211ENST00000586773 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
CIRBP-211ENST00000586773 KIF27Q86VH2 1401 aa35.29■■■■□ 3.24
CIRBP-211ENST00000586773 NUP160Q12769 1436 aa35.13■■■■□ 3.21
CIRBP-211ENST00000586773 IGF1RP08069 1367 aa35.13■■■■□ 3.21
CIRBP-211ENST00000586773 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.12■■■■□ 3.21
CIRBP-211ENST00000586773 CEP170Q5SW79 1584 aa35.08■■■■□ 3.21
CIRBP-211ENST00000586773 CUL7Q14999 1698 aa35.06■■■■□ 3.2
CIRBP-211ENST00000586773 ARAP1Q96P48 1450 aa35.03■■■■□ 3.2
CIRBP-211ENST00000586773 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.94■■■■□ 3.18
CIRBP-211ENST00000586773 SHROOM2Q13796 1616 aa34.88■■■■□ 3.17
CIRBP-211ENST00000586773 JPH4Q96JJ6 628 aa34.85■■■■□ 3.17
CIRBP-211ENST00000586773 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.81■■■■□ 3.16
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