Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KRW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KRW8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KRW8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KRW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KRW8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KRW8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KRW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KRW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KRW8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KRW8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KRW8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KRW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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