Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF4Q2M2E3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODF4Q2M2E3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms