Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA0040Q15053 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA0040Q15053 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms