Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 URA2YJL130C 6645 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 DUN1YDL101C 1542 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 PHR1YOR386W 1698 nt4□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 AVT7YIL088C 1473 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 HUL5YGL141W 2733 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 ERG11YHR007C 1593 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SLU7YDR088C 1149 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YDR090CYDR090C 933 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SOP4YJL192C 705 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 EAF6YJR082C 342 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YJR111CYJR111C 852 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 GTT2YLL060C 702 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 TOA1YOR194C 861 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YPL035CYPL035C 348 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 MIP6YHR015W 1980 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YJR030CYJR030C 2238 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 STE24YJR117W 1362 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SLY41YOR307C 1362 nt3.99□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 EBS1YDR206W 2655 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YML096WYML096W 1578 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 CPA2YJR109C 3357 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 VPS30YPL120W 1674 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 ELM1YKL048C 1923 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 PBP4YDL053C 558 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 STE14YDR410C 720 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 MTC3YGL226W 372 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 UPF3YGR072W 1164 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 RSR1YGR152C 819 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YHR097CYHR097C 1101 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YJR037WYJR037W 384 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 IMP4YNL075W 873 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SRP1YNL189W 1629 nt3.98□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 ASM4YDL088C 1587 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 AKR1YDR264C 2295 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 CDC5YMR001C 2118 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YPD1YDL235C 504 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 FMP32YFL046W 624 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YIL029CYIL029C 429 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SDL1YIL167W 633 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 SRP21YKL122C 504 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 ECM4YKR076W 1113 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YPT7YML001W 627 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 YNL046WYNL046W 519 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 ATX2YOR079C 942 nt3.97□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 LCB5YLR260W 2064 nt3.96□□□□□ -1.77
CLF1Q12309 FRE4YNR060W 2160 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 ALG8YOR067C 1734 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 FLO5YHR211W 3228 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 CLB3YDL155W 1284 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YDL187CYDL187C 330 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 GOS1YHL031C 672 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YET1YKL065C 621 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 ATG10YLL042C 504 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PBA1YLR199C 831 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 FYV5YCL058C 459 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 BYE1YKL005C 1785 nt3.96□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 RPA14YDR156W 414 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 NCB2YDR397C 441 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 MIG3YER028C 1185 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 NFU1YKL040C 771 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 RPC37YKR025W 849 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YLL044WYLL044W 447 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 TOM22YNL131W 459 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YNL276CYNL276C 396 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.95□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 VPS33YLR396C 2076 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 ITT1YML068W 1395 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 NOP12YOL041C 1380 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PEX10YDR265W 1014 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PAU10YDR542W 363 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YFL015CYFL015C 495 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 CGR1YGL029W 363 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YGL074CYGL074C 327 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PAU11YGL261C 363 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PAU13YHL046C 363 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 SNX4YJL036W 1272 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 EMC2YJR088C 879 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YKL070WYKL070W 510 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 IDP2YLR174W 1239 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PAU4YLR461W 363 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 LDS2YOL047C 1071 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 TMA108YIL137C 2841 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 HDA2YDR295C 2025 nt3.94□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 FAD1YDL045C 921 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YDR114CYDR114C 303 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YDR431WYDR431W 312 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PRM8YGL053W 714 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 LRP1YHR081W 555 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 APD1YBR151W 951 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 RSC1YGR056W 2787 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 RAD5YLR032W 3510 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 RNT1YMR239C 1416 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 WHI3YNL197C 1986 nt3.93□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 SNU56YDR240C 1479 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PKP2YGL059W 1476 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 MRPL11YDL202W 750 nt3.92□□□□□ -1.78
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