Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS1P54277 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS1P54277 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS1P54277 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMS1P54277 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS1P54277 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMS1P54277 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS1P54277 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS1P54277 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS1P54277 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms