Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
SETD1BQ9UPS6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SETD1BQ9UPS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SETD1BQ9UPS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SETD1BQ9UPS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SETD1BQ9UPS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SETD1BQ9UPS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
SETD1BQ9UPS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SETD1BQ9UPS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
SETD1BQ9UPS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SETD1BQ9UPS6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SETD1BQ9UPS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SETD1BQ9UPS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SETD1BQ9UPS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SETD1BQ9UPS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SETD1BQ9UPS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SETD1BQ9UPS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SETD1BQ9UPS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SETD1BQ9UPS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SETD1BQ9UPS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SETD1BQ9UPS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SETD1BQ9UPS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SETD1BQ9UPS6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SETD1BQ9UPS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SETD1BQ9UPS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
SETD1BQ9UPS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SETD1BQ9UPS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
SETD1BQ9UPS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SETD1BQ9UPS6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms