Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD1Q9ULT8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HECTD1Q9ULT8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HECTD1Q9ULT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HECTD1Q9ULT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HECTD1Q9ULT8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms