Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CDV3Q9UKY7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDV3Q9UKY7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDV3Q9UKY7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDV3Q9UKY7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDV3Q9UKY7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDV3Q9UKY7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDV3Q9UKY7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms