Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00474Q9P2X8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00474Q9P2X8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00474Q9P2X8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00474Q9P2X8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00474Q9P2X8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00474Q9P2X8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms