Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PHRF1Q9P1Y6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PHRF1Q9P1Y6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PHRF1Q9P1Y6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHRF1Q9P1Y6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PHRF1Q9P1Y6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PHRF1Q9P1Y6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PHRF1Q9P1Y6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PHRF1Q9P1Y6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PHRF1Q9P1Y6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PHRF1Q9P1Y6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PHRF1Q9P1Y6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PHRF1Q9P1Y6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PHRF1Q9P1Y6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms