Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRAGCQ9HB90 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRAGCQ9HB90 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRAGCQ9HB90 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRAGCQ9HB90 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRAGCQ9HB90 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RRAGCQ9HB90 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRAGCQ9HB90 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRAGCQ9HB90 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRAGCQ9HB90 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRAGCQ9HB90 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRAGCQ9HB90 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRAGCQ9HB90 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRAGCQ9HB90 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
RRAGCQ9HB90 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRAGCQ9HB90 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RRAGCQ9HB90 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRAGCQ9HB90 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRAGCQ9HB90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RRAGCQ9HB90 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRAGCQ9HB90 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRAGCQ9HB90 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRAGCQ9HB90 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms