Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PDGFDQ9GZP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PDGFDQ9GZP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PDGFDQ9GZP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PDGFDQ9GZP0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PDGFDQ9GZP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDGFDQ9GZP0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDGFDQ9GZP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PDGFDQ9GZP0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDGFDQ9GZP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDGFDQ9GZP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDGFDQ9GZP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDGFDQ9GZP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDGFDQ9GZP0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDGFDQ9GZP0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDGFDQ9GZP0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDGFDQ9GZP0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PDGFDQ9GZP0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PDGFDQ9GZP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PDGFDQ9GZP0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDGFDQ9GZP0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDGFDQ9GZP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PDGFDQ9GZP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PDGFDQ9GZP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms