Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDF1Q9BYJ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YTHDF1Q9BYJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDF1Q9BYJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YTHDF1Q9BYJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YTHDF1Q9BYJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
YTHDF1Q9BYJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YTHDF1Q9BYJ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YTHDF1Q9BYJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YTHDF1Q9BYJ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YTHDF1Q9BYJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms