Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL25A1Q9BXS0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL25A1Q9BXS0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL25A1Q9BXS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COL25A1Q9BXS0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL25A1Q9BXS0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL25A1Q9BXS0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms