Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCNX1Q96RV3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX1Q96RV3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX1Q96RV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX1Q96RV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNX1Q96RV3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNX1Q96RV3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms