Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARXQ96QS3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ARXQ96QS3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARXQ96QS3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARXQ96QS3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ARXQ96QS3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ARXQ96QS3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARXQ96QS3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARXQ96QS3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms