Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMG1Q96Q15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMG1Q96Q15 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMG1Q96Q15 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMG1Q96Q15 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMG1Q96Q15 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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