Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBE2E2Q96LR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2E2Q96LR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2E2Q96LR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E2Q96LR5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2E2Q96LR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms