Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 35.9
FUBP3Q96I24 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 35.9
FUBP3Q96I24 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.585e-11■■■■■ 35.9
FUBP3Q96I24 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 35.8
FUBP3Q96I24 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 35.8
FUBP3Q96I24 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 35.8
FUBP3Q96I24 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 35.8
FUBP3Q96I24 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 35.8
FUBP3Q96I24 SETX-202ENST00000436441 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.51□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 35.7
FUBP3Q96I24 SETX-205ENST00000477049 4067 ntTSL 37.25□□□□□ -1.256e-8■■■■■ 35.7
FUBP3Q96I24 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 35.7
FUBP3Q96I24 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 35.6
FUBP3Q96I24 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 35.6
FUBP3Q96I24 SORL1-209ENST00000530365 983 ntTSL 510.91□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 35.6
FUBP3Q96I24 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 35.6
FUBP3Q96I24 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 35.6
FUBP3Q96I24 TMEM56-RWDD3-201ENST00000604203 680 ntTSL 36.8□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 35.6
FUBP3Q96I24 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.766e-12■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 WEE1-205ENST00000527848 465 ntTSL 28.25□□□□□ -1.096e-12■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 VWCE-203ENST00000398808 717 ntTSL 316.83■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.026e-8■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.134e-8■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 CPOX-203ENST00000512905 593 ntTSL 55.57□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 35.4
FUBP3Q96I24 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.836e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.086e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 06e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.376e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.646e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.966e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC8.84□□□□□ -16e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.086e-9■■■■■ 35.2
FUBP3Q96I24 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.185e-20■■■■■ 35.1
FUBP3Q96I24 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 35
FUBP3Q96I24 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 35
FUBP3Q96I24 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 426.59■■□□□ 1.857e-8■■■■■ 34.9
FUBP3Q96I24 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.87e-8■■■■■ 34.9
FUBP3Q96I24 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 516.44■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 34.9
FUBP3Q96I24 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 34.9
FUBP3Q96I24 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.077e-8■■■■■ 34.9
FUBP3Q96I24 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.77e-8■■■■■ 34.9
FUBP3Q96I24 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 34.8
FUBP3Q96I24 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 34.8
FUBP3Q96I24 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 412.9□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 34.8
FUBP3Q96I24 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 34.8
FUBP3Q96I24 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 34.8
FUBP3Q96I24 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 34.7
FUBP3Q96I24 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 510.63□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 34.6
FUBP3Q96I24 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 34.6
FUBP3Q96I24 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 34.5
FUBP3Q96I24 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 225.52■■□□□ 1.684e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.154e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 512.27□□□□□ -0.454e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.574e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 57.22□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 37.22□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 34.4
FUBP3Q96I24 SLC2A3-209ENST00000543435 383 ntTSL 310.7□□□□□ -0.71e-12■■■■■ 34.3
FUBP3Q96I24 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 34.3
FUBP3Q96I24 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 34.2
FUBP3Q96I24 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 34.2
FUBP3Q96I24 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 34.1
FUBP3Q96I24 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 34.1
FUBP3Q96I24 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.194e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-206ENST00000557822 545 ntTSL 416.32■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 216.32■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 216.16■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 514.76□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-210ENST00000559343 577 ntTSL 413.56□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-207ENST00000558234 3910 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-212ENST00000560004 544 ntTSL 412.13□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 FNIP2-203ENST00000504715 724 ntTSL 511.05□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-206ENST00000444971 1508 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-205ENST00000551975 749 ntTSL 310.7□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 FNIP2-206ENST00000512986 2173 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 LRIG1-207ENST00000496559 4129 ntTSL 28.8□□□□□ -14e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 33.7
FUBP3Q96I24 FNIP2-202ENST00000504704 3704 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 33.7
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 184 ms