RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543447.5

ATE1-209, Transcript of arginyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 4,826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1-209ENST00000543447 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.32■■■□□ 2.44
ATE1-209ENST00000543447 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.83■■■□□ 2.05
ATE1-209ENST00000543447 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.42■■□□□ 1.98
ATE1-209ENST00000543447 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
ATE1-209ENST00000543447 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.67■■□□□ 1.7
ATE1-209ENST00000543447 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.58■■□□□ 1.69
ATE1-209ENST00000543447 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.52■■□□□ 1.68
ATE1-209ENST00000543447 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ATE1-209ENST00000543447 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
ATE1-209ENST00000543447 TRIM41Q8WV44 630 aa25.33■■□□□ 1.64
ATE1-209ENST00000543447 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.2■■□□□ 1.63
ATE1-209ENST00000543447 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.13■■□□□ 1.61
ATE1-209ENST00000543447 HRCP23327 699 aa24.92■■□□□ 1.58
ATE1-209ENST00000543447 ABCC9O60706 1549 aa24.86■■□□□ 1.57
ATE1-209ENST00000543447 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
ATE1-209ENST00000543447 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ATE1-209ENST00000543447 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
ATE1-209ENST00000543447 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ATE1-209ENST00000543447 SCRIBQ14160 1630 aa24.54■■□□□ 1.52
ATE1-209ENST00000543447 APLP2Q06481 763 aa24.53■■□□□ 1.52
ATE1-209ENST00000543447 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ATE1-209ENST00000543447 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.5■■□□□ 1.51
ATE1-209ENST00000543447 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ATE1-209ENST00000543447 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
ATE1-209ENST00000543447 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.35■■□□□ 1.49
ATE1-209ENST00000543447 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
ATE1-209ENST00000543447 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
ATE1-209ENST00000543447 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
ATE1-209ENST00000543447 NACADO15069 1562 aa23.89■■□□□ 1.42
ATE1-209ENST00000543447 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ATE1-209ENST00000543447 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ATE1-209ENST00000543447 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.81■■□□□ 1.4
ATE1-209ENST00000543447 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ATE1-209ENST00000543447 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.76■■□□□ 1.39
ATE1-209ENST00000543447 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.76■■□□□ 1.39
ATE1-209ENST00000543447 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
ATE1-209ENST00000543447 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.59■■□□□ 1.37
ATE1-209ENST00000543447 ITGAEP38570 1179 aa23.56■■□□□ 1.36
ATE1-209ENST00000543447 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ATE1-209ENST00000543447 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ATE1-209ENST00000543447 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ATE1-209ENST00000543447 WIZO95785 1651 aa23.33■■□□□ 1.33
ATE1-209ENST00000543447 CEP162Q5TB80 1403 aa23.29■■□□□ 1.32
ATE1-209ENST00000543447 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
ATE1-209ENST00000543447 EEA1Q15075 1411 aa23.22■■□□□ 1.31
ATE1-209ENST00000543447 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.22■■□□□ 1.31
ATE1-209ENST00000543447 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
ATE1-209ENST00000543447 SOGA1O94964 1423 aa23.18■■□□□ 1.3
ATE1-209ENST00000543447 ABCC8Q09428 1581 aa23.18■■□□□ 1.3
ATE1-209ENST00000543447 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.17■■□□□ 1.3
ATE1-209ENST00000543447 GOLGA3Q08378 1498 aa23.15■■□□□ 1.3
ATE1-209ENST00000543447 CLIP1P30622 1438 aa23.13■■□□□ 1.29
ATE1-209ENST00000543447 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATE1-209ENST00000543447 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATE1-209ENST00000543447 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ATE1-209ENST00000543447 P3H3Q8IVL6 736 aa23.03■■□□□ 1.28
ATE1-209ENST00000543447 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.03■■□□□ 1.28
ATE1-209ENST00000543447 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ATE1-209ENST00000543447 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.98■■□□□ 1.27
ATE1-209ENST00000543447 SMARCA4P51532 1647 aa22.95■■□□□ 1.26
ATE1-209ENST00000543447 NEUROD1Q13562 356 aa22.93■■□□□ 1.26
ATE1-209ENST00000543447 NEFLP07196 543 aa22.83■■□□□ 1.24
ATE1-209ENST00000543447 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATE1-209ENST00000543447 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.79■■□□□ 1.24
ATE1-209ENST00000543447 SMARCA2P51531 1590 aa22.76■■□□□ 1.23
ATE1-209ENST00000543447 KIF27Q86VH2 1401 aa22.74■■□□□ 1.23
ATE1-209ENST00000543447 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.7■■□□□ 1.22
ATE1-209ENST00000543447 MIER1Q8N108 512 aa22.67■■□□□ 1.22
ATE1-209ENST00000543447 TRIM52Q96A61 297 aa22.67■■□□□ 1.22
ATE1-209ENST00000543447 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.66■■□□□ 1.22
ATE1-209ENST00000543447 ARID3CA6NKF2 412 aa22.61■■□□□ 1.21
ATE1-209ENST00000543447 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.56■■□□□ 1.2
ATE1-209ENST00000543447 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.55■■□□□ 1.2
ATE1-209ENST00000543447 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ATE1-209ENST00000543447 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ATE1-209ENST00000543447 ANP32CO43423 234 aa22.48■■□□□ 1.19
ATE1-209ENST00000543447 CUX2O14529 1486 aa22.48■■□□□ 1.19
ATE1-209ENST00000543447 FBLN2P98095 1184 aa22.45■■□□□ 1.18
ATE1-209ENST00000543447 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ATE1-209ENST00000543447 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.42■■□□□ 1.18
ATE1-209ENST00000543447 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.41■■□□□ 1.18
ATE1-209ENST00000543447 BCANQ96GW7 911 aa22.41■■□□□ 1.18
ATE1-209ENST00000543447 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.4■■□□□ 1.18
ATE1-209ENST00000543447 TONSLQ96HA7 1378 aa22.38■■□□□ 1.17
ATE1-209ENST00000543447 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.36■■□□□ 1.17
ATE1-209ENST00000543447 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.36■■□□□ 1.17
ATE1-209ENST00000543447 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.35■■□□□ 1.17
ATE1-209ENST00000543447 MYT1Q01538 1121 aa22.31■■□□□ 1.16
ATE1-209ENST00000543447 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATE1-209ENST00000543447 SYNJ1O43426 1573 aa22.3■■□□□ 1.16
ATE1-209ENST00000543447 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ATE1-209ENST00000543447 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.25■■□□□ 1.15
ATE1-209ENST00000543447 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.25■■□□□ 1.15
ATE1-209ENST00000543447 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ATE1-209ENST00000543447 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.24■■□□□ 1.15
ATE1-209ENST00000543447 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ATE1-209ENST00000543447 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.21■■□□□ 1.15
ATE1-209ENST00000543447 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.19■■□□□ 1.14
ATE1-209ENST00000543447 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.17■■□□□ 1.14
ATE1-209ENST00000543447 NCAPD3P42695 1498 aa22.17■■□□□ 1.14
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