Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NKD1Q969G9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKD1Q969G9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NKD1Q969G9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKD1Q969G9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKD1Q969G9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD1Q969G9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKD1Q969G9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms