Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBEAQ8NFP9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NBEAQ8NFP9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NBEAQ8NFP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NBEAQ8NFP9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NBEAQ8NFP9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBEAQ8NFP9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms