Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R0

LINC00304, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00304, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00304Q8N9R0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00304Q8N9R0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00304Q8N9R0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00304Q8N9R0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00304Q8N9R0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms