Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N2

TRPM1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM1Q7Z4N2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRPM1Q7Z4N2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRPM1Q7Z4N2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRPM1Q7Z4N2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
TRPM1Q7Z4N2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRPM1Q7Z4N2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TRPM1Q7Z4N2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TRPM1Q7Z4N2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRPM1Q7Z4N2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRPM1Q7Z4N2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRPM1Q7Z4N2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
TRPM1Q7Z4N2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRPM1Q7Z4N2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRPM1Q7Z4N2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRPM1Q7Z4N2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRPM1Q7Z4N2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRPM1Q7Z4N2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRPM1Q7Z4N2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms